La segunda opción parece mucho más equilibrada, y te explico...
Las pastillas de tu strat (sean las 54 o 69) son unas pastillas con una salida MUY baja mientras que la JB de SD tiene unan salida bastante bastante alta y que si las pones en pareja... si tienes un overdrive con tu JB en cuanto pases a las single coil te sonará limpio prácticamente... si no lo buscas a posta, ya ves que será un gran problema ya que, dependiendo de si queires distorsión o no, tendrás que usar solo una pastilla y no podrás ir cambiando durante la canción, porque la diferencia de sonido será drástica...
En la segunda opción, la Lace Sensor tiene una salida más alta que las single de tu strat, pero tampoco es algo TAN TAN diferente, y al ser en puente pues la diferencia será algo menor y bastante más equilibrada. Notarás una diferencia notoria en cuanto a distorsión al cambiar de puente a otra de las pastillas, pero non será exagerada, a diferncia de si pones la JB. En la Tele, lo que te pasará es que sí que notarás bastante el cambio, así como pasaría en la Strat si le pones la JB pero seamos listos: cuánto cuesta cambiar una pastilla en la tele? Y dos en la strat? Además, fuera de eso, la Tele tiene un sonido mucho más denso y lleno, con más cuerpo y graves que le sentarán mejor a una pastilla tan cañera y filuda como la JB, mientras que en la Strat sonará algo más esteril y carente de medios (he tenido una JB en una guitarra de aliso con forma Strat, uan Squier 51, y me encanta como suena, pero suena algo pobre de medios, y mira qu eel Aliso tiene medios potentes).
Eso sí... si haces covers de Deep Purple... qué te parece la idea de dejar la Tele como está y ponerle unas SD Quarter Pound for Strat en mástil y puente (en medio si quieres te ahorras el dinerito) a la Strat y dejarla como la del señorito Blackmore? además, una versión de estas Quarter Pound pueden ser "tapped", es decir, que puedes utilizar solo una porción del bobinado (viene con 3 cables en lugar de 2) por lo que podrías, con un potenciómetro push-pull o similar, cambiar entre el sonido de una single coil clásica y el sonido de una single coil super cañera como la Quarter Pound, pero n ote equivoques, la Quarter Pound es una single coil de verdad, nada de "stacked" o "rails", por lo que seguirás teniendo el ruidito de los 60Hz, etc. como en una single coil "real". Si quieres evitar también ese ruido, entonces no te queda otra que lo dicho arriba
PD: Pedazo guitarras tienes tío, genials