A ver si me atrevo a contestar sin decir ninguna barbaridad que no soy precisamente el más entendido ;-)
La menor es el relativo menor de de Do Mayor. Por eso las notas de ambas coinciden.
Si tienes una base en Do mayor, puedes usar las posiciones de la pentatónica de la menor sin ningún problema. Pero has de tener en cuenta, que las tónicas cambian.
Por ello deberías enfatizar los Do's en...