Hola!!
Quizas es la version del Eagle que estas usando, si es la "free" tiene limitaciones y estas tratando de poner el rele sobre una parte que no se puede :D
De todas formas, si vas a seguir con eso, mejor pasarse a otros softwares, por ejemplo nosotros nos pasamos de Eagle a Kicad, aunque al principio dolio, ahora estamos felices, con el modelo 3d de las placas uff una pasada
Saludos ...