Realmente yo en mi vida nunca me había planteado esto, desde que me llego mi primera guitarra que no le di importancia y seguramente sera esto. Afina con cualquier pastilla, como si cojes un afinador con micrófono y lo haces sin tenerla conectada a ninguna ampli. A ver que responde la gente, pero yo creo que no tiene importancia la pastilla.
Yo creo que no importa con qué pastilla afines (siempre que la pastilla funcione correctamente, claro). Aunque he leído que la pastilla del mástil a veces da una lectura más estable de la afinación, por tener menos agudos.
Lo que sí tienes que mirar que la ruedecilla de volumen de la guitarra esté al máximo para que llegue bastante señal.
No tiene que haber diferencia entre una pastilla u otra, lo que se mide con el afinador es a qué frecuencia vibra la cuerda en cuestión y eso es independiente de la pastilla que uses para captar dichas vibraciones, ya que la cuerda va a vibrar en la misma frecuencia con una pastilla o con otra.
Para afinar da igual, pero para quintar mejor la pastilla de mástil, ya que si no es una guitarra de 24 trates, debe tener la pastilla justo donde hay un armónico