Hola!
Lo que probablemente pase, es que estés mezclando la distorsión del joyo con alguna simulación de amplificador o distorsión del Digitech.
Además de descartar problemas adicionales (como serían el uso de pastillas de bobinado simple, una guitarra sin apantallamiento, o una mala calidad de los cables o de la toma de tierra), lo primero que deberías de hacer es programar un patch en la RP en donde estén desactivadas las simulaciones de amplificadores, de distorsión, y ojo, los compresores.
¿Por qué?
Un efecto de saturación aumenta la ganancia, entonces, si sumas 2 saturaciones, también sumas la ganancia de ambas. Pero al aumentar la ganancia, también estás amplificando los ruidos parásitos. Y el compresor a final de cuentas también lo hace.
Una vez bien seteado el patch en limpio, utiliza la puerta de ruido de la pedalera, ajustando el nivel hasta que disminuya de manera notable el ruido, sin afectar tanto el sonido de la guitarra. Es cuestión de encontrarle el punto de equilibrio.
A partir de este punto de equilibrio podrás ir agregando diversos efectos, según te dicte tu oído.
Espero que te funcione.
Saludos