Por el momento, tranquilo, la construcción de tu Les Paul es la correcta: el mástil entra con ese ángulo como te dicen. Luego, la acción de la guitarra sí que está muy alta, y si dices que le has subido el puente pues ya sabes la causa. Con las fotos no veo que el mástil esté curvo, pero bueno, seguro que el Bro te lo sabe ajustar.
También podrías cambiar de luthier por aquello de probar, porque quizá te guste más cómo lo haga otro.