Pues eso significa que el pedal es truebypass, así que lo mas probable es que el ruido provenga del propio amplificador, de los cables o de la misma guitarra.
A seguir haciendo pruebas...
Bueno, finalmente he encontrado el origen del mal . Era la fuente de alimentación del portátil que conectada a tierra metía un ruido que pa´ qué.
Lo he solucionado poniendo cinta aislante en la patilla de tierra del enchufe del portátil. Ahora sigue oyéndose ruido, pero es el ruido admisible que se genera con la guitarra y amplificador.