Hay que poner la cámara a grabar al mismo tiempo que grabas en tu ordenador mediante una interface USB. Si tienes un procesador de efectos, tipo Line 6 POD y similares, manejas de allí tus efectos y grabas directamente a un editor de audio tipo Reaper 4, Cubase, Ableton, ProTolls, etc.
También existe la opción de conectar la guitarra directo a la interfaz y usar programas como Guitar Rig, TH2, Amplitube, etc., para aplciar los efectos.
Luego el audio resultante se junta con el video mediente un editor de video. Puede ser el típico Windows Moovie Maker o Sony Vegas, o similares. Ahí lo debes sincronizar con el video.
Eso es en términos generales lo que se hace para tener esa calidad de grabación.
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y si tengo un microfono condesador, con que programa puedo grabar el sonido que hago?
Con los mismos programas que mencioné. Puse de ejemplo la guitarra pero es para todo: lo que sea que le conectes a la interfaz, eso es lo que graba.