Creo que por la entrada de micrófono (Enchufando la guitarra a dicha entrada) se puede grabar con el Guitar rig y Amplitube, pero mete mas ruido de fondo que con la Line in.
Podrias hacer lo que dice el compañero Andrew y probar las interfaces a ver como te va
PD: Es básico, pero tambien pod´podés microfonear ampli si tienes, conectandolo a su correspondiente entrada.
No se que version de windows tienes o que sistema operativo. En windows en panel de control donde esta la configuración de sonido generalmente te deja convertir la entrada del micrófono en un line in. chequea en esa parte y problema resuelto, pero es la misma entrada de micrófono solo que con parámetros para entrada de linea