bueno, me imagino que estas conectando la zoom a la entrada line-in de la tarjeta de audio del pc, si es asi te recomiendo que utilices una interfaz de audio para grabarte, ya que como lo haces aparte de que te introduce ruido no es lo ideal para grabar, en el mercado hay interfaz que te aseguran latencias minimas, ya sea por puerto usb, fireware, etc etc
Si vas a utilizar una pedalera...no te recomiendo intentar usar el Guitar Rig...si tienes problemas de latencia seguro sera pq no tienes una buena placa de audio en tu ordenador. El guitar rig es demasiado pesado, aun utilizando un controlador ASIO.