Buenas, pues de capacidad de proceso creo que son similares. Yo optaría por el FM3, porque es hardware más reciente, pantalla color, más pequeño y ligero, y de paso es más polivalente, si lo quisieras llevar a algún sitio es más portable. Para el uso que le vas a dar en casa de entradas y salidas vas sobrado, y de paso tienes tres footswitch, que evidentemente en el Fx2 no los tienes.
3