Hola fran, te voy a responder desde el poco conocimiento que tengo,
si vas a tocar en C mayor, tambíen sonará bien la pentatónica menor de su menor equivalente, A menor en el caso de C mayor
puede ser que tocando la mayor de C hayas probado a tocar fuera de la pentatónica y seguramente las notas que te hayan sonado bien se encuentren dentro de la escala DIATONICA mayor de C
espero haberte ayudado, pero un servidor es novato y no llega a más jajaja
Saludooos
Básicamente la pentatónica menor suena bien sobre acordes menores y mayores y la mayor sólo sobre acordes mayores.
Pero lo mejor es probar, si te suena bien está bien.
Respecto a cambiar una mayor por su relativa menor, en realidad no cambias nada, tienen las mismas notas.