Yo creo que si, no lo he probado, pero tu cuando configuras un preset, una de las opciones es activar o desactivar hasta dos swits. Imagino que habra que conectar un jack de la salida de la pedalera a la entrada swit del ampli.
Si se puede, yo la he usado para ese mismo propósito, debes programar los switch en cada banco y conectar las salidas del FCB1010 al amplificador, el fcb1010 actúa como un footswitch de 2 botones