Bueno, eso pasa hasta en las mejores familias
Lo del ruido de masa es más o menos normal en los montajes en protoboard. Seguramente mejorará si conectas todas las masas y el negativo de la pila en puntos muy cercanos en el mismo rail. También hay que tener en cuenta que has configurado una ganancia muy alta, con lo cual estás amplificando innecesariamente el ruido al mismo tiempo que tendrás que reducir el nivel de entrada de la señal con los potenciómetros. Una ganancia tan alta con tensión de alimentación tan baja es absurda. Fíjate que tienes la masa virtual del operacional en 4.5V, y la tensión mínima que puedes conseguir en la salida son 1.4V, sólo 3.1V menos; lo cual quiere decir que, con señales de salida de más de 6.2Vpp, el operacional ya estará haciendo clipping por abajo; y como la ganancia en tensión es de 10, estarías haciendo clipping con señales de entrada de sólo 0.62Vpp y tendrías que bajar los potes de entrada... pero seguirías multiplicando por 10 el ruido de masa.
Un par de consejos para mejorar eso:
En primer lugar, centra la masa virtual del operacional. Tienes 4.2V hasta el máximo en la salida y sólo 3.1V hasta el mínimo. Si subes un poco la masa virtual podrías aumentar algo la excursión antes de hacer clipping. Poniendo una resistencia de 15K en serie con R11, subirías las masa virtual hasta 4.8V, lo que te permitiría una excursión desde 1.4V hasta 8.2V antes de hacer clipping. 6.8V de excursión máxima en lugar de los 6.2V actuales.
En segundo lugar, añade un control de ganancia para no amplificar más de lo necesario, así evitarás amplificar el ruido innecesariamente. Puedes hacerlo como un ajuste interno con una resistencia ajustable de 100K o como un control externo con un potenciómetro de 100K log. habría que unir el terminal del cursor con uno de los extremos, y ponerlo en serie con R10, ya sea entre el pin1 y R10 o entre R10 y el pin6. Con eso consigues ajustar la ganancia entre el X10 actual y una ligera atenuación, aproximadamente X0.91. Lo ideal es ajustar R1 y R2 al máximo posible, usándolos sólo para ecualizar los niveles de las dos entradas, y luego ajustar el volumen actuando sobre el control de ganancia; así evitas atenuar la señal innecesariamente para luego volver a amplificarla con ruido incluído.
Por último, hablabas en tu primer post de conectar a las entradas una guitarra eléctrica... no es buena idea con una impedancia de entrada tan baja (10K de R1 y R2). La impedancia de salida de una guitarra eléctrica con pastillas pasivas es muy alta, típicamente entre 250k y 500K en función del tipo de pastillas, y con una carga tan alta tiras la señal por el suelo para luego amplificar ruido.