El Rock Discipline viene muy bien para el tema de la tecnica,no creo que te sirva para las escalas y modos.
Aqui hay varias opciones que conozco, de las demas no hablo por que no se:
1- Teoría Musical y Armonía Moderna (Enric Herrera)- Estos libros estan muy bien, van de lo mas basico a conceptos bastante avanzados. La unica pega es que sin un profesor son algo durillos, pero siempre te queda el foro
2- Los libros de Armonía y Guitarra de Berklee- Los de enric herrera son practicamente traducciones de estos, aunque estos estan quizas algo mas completos. La pega es que estan en ingles, y para autodidactas siguen siendo algo duros. Disponibles en la mula.
3- Los libros de guitarra del Musicians Institute- Digamos que son parecidos a los de Berklee, en ingles tambien, aunque para mi gusto son un poco peores porque basan todo demasiado en los patrones, y menos en notas y partituras. No obstante, si no quieres aprender solfeo (que deberías si quieres aprender armonia a fondo, pero bueno) seguramente te sirvan mas que los dos primeros.
4- Cualquier libro y articulo de Frank Gambale- Una vez que tengas un conocimiento medio de las escalas mayores y menores y los acordes (septimas, novenas, etc.), los articulos de este hombre en armonía modal te ayudaran a meterte en la musica modal sin destrozarte demasiado las neuronas. Disponibles donde siempre ^_^
5-A partir de aqui es mas que nada buscar articulos o libros sobre temas especificos, ya sea guitarra jazz, solos, o lo que sea. Tanto Berklee como el MIT tienen una serie de "cuadernillos", muchos de ellos con cd, sobre cuestiones concretas. Algunos estan disponibles gratis "por ahi".
Un saludo y a no desanimarse. Es un proceso lento pero cuando mires atrás veras como con el tiempo comprendes cosas que antes ni te imaginabas