@Cristopher
Tu diapasón no es plano, es curvo. Esa curvatura, que tienen casi todos los diapasones, varía por construcción de unos a otros. Se le llama radio, y normalmente se mide en pulgadas. Lo normal es que, tanto en la cejuela como en el puente, se respete ese radio, para conseguir que la guitarra sea cómoda. La distancia entre cuerdas no tiene nada que ver en este caso.
Lo que te están diciendo es que, ya que el diapasón tiene una curvatura determinada, es normal que la 1ª y la 6ª estén más bajas. Esto es para que todas las cuerdas estén a la misma distancia del diapasón, y no tengas que apretar más unas cuerdas que otras a la hora de tocar. Esto se varía con los tornillitos que te ha marcado hate1.
De todas formas, hay un post en el foro, que se ha currado Demolitiontatoo,
https://www.guitarristas.info/foros/mantenimiento-basico-guitarra-bajo/150681.
Léetelo, aprenderás a ajustarte tu propio instrumento, que es una parte importantísima. Ya verás como, cuando te lo ajustes a tu gusto, inmediatamente te parecerá que te has comprado una guitarra nueva... Y le perderás el miedo a tocar cosas en tu instrumento que, por otra parte, deberías saber para qué sirven!
Salud!