Bueno, la cosa es muy sencilla. Hay muchos tipos de pastilla, pero los mas comunes son pastillas simples (para decirlo de alguna manera son las tipo stratocaster, telecaster, ...); despues hay las humbucker, que son dos simples unidas en la bobina (habitualmente las llevan las gibson) y luego hay otras que gibson las denomina p90, que son una pastilla simple con la pegada de una humbucker, pero esas solo se ven en algunas les paul y algunas sg.
Tambien tenemos pastillas (bueno, no son pastillas, pero por decirlo de alguna manera) acusticas, que actuan a modo de microfono.
Esto es lo mas comun. A partir de ahi hay que ver lo que se usa o lo que se quiere. Ibanez, en muchas de sus guitarras monta dos pastillas humbucker (dobles) y una single (en el medio de las otras dos) a modo de poder emular una stratocaster pero de manera mas potente.
Y luego hay que decir que cada tipo de pastilla lleva sus accesorios, por ejemplo pastillas simples se recomienda potes de 250 K y condensadores de 022, y pastillas dobles se recomienda potes de 500 K y condensadores de 033, habiendo gente que prefiere los de 047. Pero todo es cuestion de gustos.
A partir de aqui hay que saber que guitarra tienes o vas a construir o lo que sea, que vas a tocar, la estetica que buscas y el presupuesto para ello.
Asi algun maestro del foro te podra ayudar de mejor manera.