A ver si te puedo aclarar un poco tus dudas. Respecto de como se ajusta la altura, efectivamente, es actuando sobre los dos tornillos que hay en los laterales de la pastilla (parte corta del rectángulo), no en las cuatro esquinas.
En cuanto a la altura es algo muy personal. Ten en cuenta que las pastillas son un elemento que genera un campo magnético sobre el que hacemos vibrar una cuerda metálica. Dicha cuerda se ve atraída por dicho campo magnético con lo que cuanto mas cerca la coloquemos de dicho campo mayor será el efecto del mismo sobre la cuerda. Prueba a subir mucho la pastilla y golpea al aire la sexta cuerda, verás como sobre la pastilla el movimiento de la cuerda hace unos movimientos fuera de lo habitual, además de que el sonido es muy metálico y borroso, nada definido, por supuesto el volumen es muy alto, si bajas el volumen del pote bajara el volumen pero no mejorará en calidad. En cambio si la bajas mucho (con cuidado de no pasarte y soltar los tornillos) notarás que el sonido es mucho mas limpio y definido (al hacer vibrar la cuerda al aire verás que vibra toda por igual si hacer el efecto extraño que hacía antes) con lo que cuando pongas algo de distorsión verás que el sonido contundente, notándose muchos matices, armónicos,..., en lugar de un enjambre de sonido sin definir. Por supuesto, la contrapartida es que el volumen decae mucho ya que la pastilla no ejerce mucha influencia sobre la vibración de la cuerda pero tampoco capta toda la vibración de la cuerda. ¿Donde está el mejor ajuste? ... es a gusto del consumidor. Yo personalmente prefiero tenerlas mas bien bajitas (lo contrario de como salen de fábrica) y si quiero volumen darlo con el ampli que para eso está.
En cuanto al orden, lo suyo es empezar por la pastilla del mastil nivelando la altura hasta conseguir el sonido que nos guste y entonces nivelar la altura en ambos lados de forma que tanto las primeras cuerdas como las últimas suenen con el mismo volumen. Una vez hecho esto se hace lo mismo con la pastilla del puente comprobando también que el sonido entre pastillas está equilibrado en cuanto a volumen.
Saludos y ya nos cuentas.