con un modelador de amps como el guitar rig,amplitube te puedes grabar la guitarra acustica eso siempre y cuando tu guitarra tenga entrada para conectarse y si no es asi entonces te sugiero que te compres una tarjeta de audio external que tenga entradas de mic.
Como te dice el compañero... dices que tienes micro, por lo tanto entiendo que es acústica y no electroacústica, pues nada, te pones el micro delante, el micro al ordena y a grabar con alegría.
Lo que tienes que gestionar es esa conexión micro <=> ordena
Una vez enchufado todo y sonando, encontrarás hilos muy interesantes sobre software para grabar en este mismo foro.