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La diferencia principal entre la Standard y la Custom es que la primera tiene cuerpo de caoba con tapa de arce, por lo que el sonido es más brillante, mientras que la Custom es toda de caoba, así que su sonido es más oscuro y profundo, con muchos graves.
La pala de la Custom tiene un logotipo en lugar de la leyenda "Les Paul" de la Standard, y en la tapa del alma pone "Custom", en lugar de "Standard". Los marcadores del diapasón son bloques (Custom), en lugar de las características coronas (Standard).
Por lo general, la Custom lleva las pastillas con tapa, y algunas montan tres pastillas en lugar de dos. Los herrajes suelen ser dorados, y el golpeador, de tres capas, negro. Tienen un binding color crema que abarca el cuerpo, mástil y pala.
La Custom apareció en 1954 (y se considera la guitarra más elegante de la historia: The Black Beauty), como alternativa a la Goldtop.
La Standard, tal y como se conoce ahora, apareció en el 57, y las más valoradas son las de los años 58, 59 y 60 (las del 59 son tan apreciadas porque se emplearon las mejores tapas de arce), y las del 60 tienen el mástil más delgado y la pala ligeramente más pequeña.
Personalmente prefiero la Standard por su estética y sonido, aunque si la Custom es una Les Paul más orientada al rock duro e incluso metal