Si es para tu estudio personal, no creo que haya problema en que la llames "Mi" y la trates como si fuera un "Mi" en tono de concierto. Especialmente si estás leyendo alguna canción escrita en tab o notación - simplemente tócala como si estuvieras en afinación normal. Te debe sonar todo bien, pero medio tono por debajo.
Sin embargo, si vas a tocar con otros músicos, como por ejemplo pianistas, debes indicarles que tu guitarra está medio tono por debajo para que hagan los ajustes necesarios (ya sea que toquen las notas medio tono por debajo, o ya sea que decidan afinar o transportar su instrumento medio tono mas grave)