Hola.
A ver si puedo ayudar un poco...
La M-Audio Fast Track USB es una interfaz de audio, se supone que hace lo que cualquier tarjeta de sonido, pero además lo enfoca a las necesidades de un guitarrista/cantante. Resumiendo: recoge la señal de una guitarra/instrumento/micrófono (dinámico, no de condensador)/salida de línea y la hace llegar al ordenador. Si quieres usar tu pedalera, debes conectarla a la entrada de línea de la Fast Track, y olvidarte del software. Otra opción es conectar directamente la guitarra (instrument) y procesarla con el software que la acompaña.
En ambos casos tendrás que elegir la Fast Track como dispositivo de audio.
¿Has comprobado que no tienes aplicado ningún efecto?
Voy a intentar ponerte un ejemplo con mi Behringer UCA202, es muy sencilla y de peor calidad que la M-Audio (al menos en teoría), pero funciona perfectamente sin ningún tipo de driver, y la he utilizado tanto en un PC de sobremesa con Windows XP como en un Apple MacBook: ni el más mínimo problema.
Dando por hecho que tienes los drivers correctamente instalados (Mi PC, botón derecho, Hardware, Administrador de dispositivos: deberías ver el dispositivo sin ninguna señal de advertencia o error), conectas la interfaz al ordenador.
En tu secuenciador, en las opciones de audio, seleccionas la Fast Track como dispositivo de entrada, si quieres monitorizar a través de ella márcala también como el dispositivo de salida. Al menos con la UCA202 puedo marcarla como entrada, pero monitorizar con el Core Audio del Mac.
Conecta la fuente de sonido a la Fast Track y deberías poder grabar/monitorizar.
Si conectas la guitarra directamente, pon el conmutador en instrument, y si es otra fuente (equipo de sonido, amplificador, pedalera...) en line in. Resumiendo: cualquier cosa que necesita alimentación y amplifique de manera autónoma necesita conectarse a line in.
Espero que esto te sirva de ayuda