Pueden ser varios motivos, desde no haber configurado el nivel de salida en el loop, hasta cables defectuosos. Revisa especificaciones de tu pedal y del ampli, cambia de cables y analiza.
ya he probado todo cables, eliminador, hasta compre el original, mi fx loop no tiene nivel, asi que esta al 100 supongo y aunque suba el nivel del efecto nada, por eso llegue a la conclusión de que es el pedal u.u
A lo que voy es que la entrada por el loop de efectos aveces de +4 db y en otros casos de -20 db, por eso te sugiero que revises las especificaciones de tu pedal y ampli.