Hola maar-mental, bueno este tema le come la cabeza a muchos guitarristas poseedores de guitarras con floyd y que quieren afinar en tonalidades mas bajas, yo personalmente uso el tipico truco de bloquear el floyd para afinarla, hay varias maneras de hacerlo:
1. El truco de la cuchara: Este consiste en bloquear el puente desde la parte delantera de la gutiarra, poniendo una cuchara entre una esquina del puente apoyada en el cuerpo de la guitarra, dejandolo en su posicion correcta que es paralelo al cuerpo, asi aun cuando las cuerdas esten totalmente destensadas el puente no se movera y facilitara mucho la afinacion, ya cuando la guitarra este afinada totalmente procedes a aflojar los muelles que se encuentran en la parte trasera de la guitarra, los aflojaras lentamente hasta que la cuchara caiga sola sin ejercerle ningun tipo de fuerza, asi las cuerdas permaneceran afinadas, el puente totalmente calibrado y listo para usarlo.
Aca tienes un video para que te ilustres mejor:
(Minuto 2:36)
2. El taco de madera: Este truco es muy similar al primero, solo que ya vamos a introducir un taco de madera en la parte donde van los muelles de la guitarra, entre el cuerpo y la pieza del puente que sostiene los muelles, este truco es un poco mas difícil de aplicar que el primero ya que hay que elaborar un taco de madera con las medidas exactas para que el puente quede en su posición correcta, yo te recomiendo mas hacer el truco de la cuchara.
En cuanto a el calibre de las cuerdas yo tengo en mi guitarra afinada en B un calibre del .11, para mi es suficiente como para mantener bien la tensión y que no se desfasen mucho las notas, aunque si quieres un mejor rendimiento en esta afinación puedes ponerle un calibre del .12 y no te dará problemas, tal vez tengas que ajustar el alma de tu guitarra, es un paso delicado pero en el foro encuentras muchos temas donde te enseñaran a hacer este paso y si lo haces bien no tendrás complicaciones.
Espero que te sirva la información y si tienes mas preguntas no dudes en postear! Buena suerte.