Bienvenido al foro.
Estiraste las cuerdas al ponerlas ? Si no lo hiciste, hazlo. O toca esperar que se acomoden solas.
Otra cosa a tener en cuenta es el lazo con el que trabas las cuerdas en las clavijas.
Pueden ser varios motivos
1.- Las cuerdas están nuevas y hasta que no asientan tendrás que ir afinando un par de días
2.- Las encordaste mal
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Puedes poner fotos de como están puestas las cuerdas tanto en el clavijero como en el puente?
Las cuerdas de nylon siempre demoran en acomodarse a diferencia de las de metal, pero después debería quedar estables.