Pues casi seguro que se ha descalibrado el pedal, es algo que pasa de vez en cuando. En este enlace te dejo el manual en pdf y en castellano de tu pedalera, ahí te viene como solucionarlo.
http://adn.harmanpro.com/product_documents/documents/148_1292881002/RP1000Manual-Spanish_original.pdf
De todas formas, copio y pego el procedimiento que se ha de hacer. Es muy sencillo, con la GNX3000 yo lo hice un par de veces y no tiene ningún secreto.
"Debe recalibrar el pedal de expresión del RP1000 para que pueda usarlo sin problemas después de un reset. Esta calibración se activa de forma automática después de que ha terminado un reset a valores de fábrica. (También puede iniciar el proceso de calibración manteniendo pulsado el pedal de disparo del preset activo durante unos 5 segundos). En el caso de que la calibración del pedal falle o que el pedal no se comporte correctamente, puede recalibrarlo usando este proceso. Esto no elimina los presets de usuario. Para realizar esta calibración haga lo siguiente
1. Mantenga pulsado el pedal de disparo del preset activo hasta que aparezca en pantalla PeDL CAL(antes de llegar a PeDALCAL aparecerá BYPAss, TUNeRy eXIT, unos 5 segundos después)
2. Cuando en pantalla aparezca el mensaje TOeDowN, pulse el pedal de expresión (puntera abajo) y pulse el pedal5 (Reverb).
3. Cuando aparezca TOeUP, tire del pedal de expresión hacia arriba (talón abajo) y pulse el pedal de disparo 5.
4. La pantalla le pedirá finalmente que calibre la sensibilidad del interruptor V-Switch
(VsWitchxxx), donde XXXserá el valor de umbral actual del V-Switch. Pulse el pedal de expresión a fondo y empuje un poco más en la puntera hasta que active el interruptor V-Switch (WAH ON) y púlselo de nuevo para desactivarlo (WAH OFF).
5. Si el V-Switch es demasiado sensible pulse arriba para aumentar el valor del umbral (rango de 0-199) o el pedal abajo para disminuirla. Siga haciendo pruebas con la sensibilidad y ajuste el umbral para que solo se active cuando realmente quiera (el ajustar un valor demasiado sensible hará que el V-Switch produzca disparos en falso al usar el pedal normalmente).
6. Cuando haya ajustado la sensibilidad del V-Switch al valor que quiera, pulse el pedal de disparo 5 para salir.
Nota: Si en la pantalla aparece la indicación eRROR eso indicará que se ha producido un error en el proceso y que debe repetir los pasos 2 a 5"