Te he hecho unos esquemas para entenderlo mejor:
Esto sería básicamente una pastilla humbucker, es decir, 2 bobinas dentro de la misma pastilla. La de arriba está en fase y la de abajo en contrafase, así se anula el "hum" o ruido de las pastillas.
Se puede conectar las dos bobinas en serie, es decir, el vivo de la primera va al vivo del potenciómetro o al switch, la masa de la primera se conecta al vivo de la segunda, y la masa de la segunda a la masa general.
Esta última imagen es de cómo vienen normalmente las pastillas humbucker (Seymour Duncan, por ejemplo), que ya vienen las bobinas independizadas en un cable apantallado con cuatro hilos. De esta manera las conexiones se hacen a nivel de potenciómetro o switch sin necesidad de tener que abrir la pastilla.
Yo te recomendaría esta última conexión pues así tienes ya las dos bobinas independientes para toda la vida. No te pongo el color de los hilos ya que varía la conexión dependiendo del fabricante (P.ej. Dimarzio y S.Duncan usan los mismos colores pero no se conectan en los mismos contactos de la bobina)
Luego tendrías que instalar un switch o un potenciómetro push-pull (esto no es más que un potenciómetro que lleva incorporado un switch funcionando ambos independientemente). Supongo que aquí en el foro habrá diversos esquemas de conexión para lograr distintas sonoridades. Si no consigues ninguno dímelo y te hago algún otro esquema de ejemplo.