bueno, no soy el guitarrista mas avanzado pero bueno voy a tratar de ayudarte y espero que después me corrijan que seguro en algo me equivoque.
según tengo entendido, no es estrictamente necesario estar teniendo en cuenta el acorde que este sonando de fondo constantemente para saber sobre que escala improvisar, con simplemente saber la Tonalidad en la que esta la cancion, la cual se dudece a partir de los acordes q esta posea, ya sabras que podes improvisar sobre cualquier acorde, en una escala que tenga como tonica a la nota que da nombre a la tonalidad de la cancion (obviamente respetando si la tonalidad es mayor o menor).
en tu ejemplo, si sabes que la tonalidad de la cancion es Em podras improvisar sobre mi menor natural, mi menor pentatonica, sus relativas mayores (G y G pentatonica),etc
espero haber sido claro y haberte ayudado.
saludo!
Adrián, lo que apunta braianwilson es muy recomendable.
Ten en cuenta que las dos formas de enfocarlo son correctas y se pueden compaginar: tocar en función a la armonía común o tratar cada acorde de manera individual.
Yo, además te recomendaría que experimentaras y juzgaras con tu oído. Prueba diferentes posibilidades y quédate con la suene correcta para ti.
Saludos!