El sitema tradicional sería hacerlo con gubia, formón y un martillo.
El mejor sistema sería con una fresadora.
Un sistema alternativo sería con un taladro de columna y alguna fresa o broca modificada.
Otro sistema eficaz sería con una Dremel y mucha paciencia.
Con una fresadora, o un luthie,r con gubia o formon si no lo has hecho nunca no enpiezes con el bajo.
Mira el grueso del cuerpo del bajo y el de las pastillas para ver si tienes madera suficiente, no vaya a ser el cuerpo muy fino.
Te seria posible poner alguna foto? por hacernos a la idea si hay que quitar mucha o poca madera.