Eso es porque al haber estado guardada el alma de la guitarra se habra movido, pur humedad o sequedad en las maderas. Tambien puede haber alterado al estar mucho tiempo guardada, pero en muy poca medida, la flexibilidad del muelle, que podria volver a su punto con un par de palancazos.
Ahora mismo lo que precisa tu guitarra es un ajuste de tensiones de alma y muelles del puente. Con esto seria suficiente, es mas creo que empezando por los muelles podrias dejar el puente bastante bajo y posiblemente el alma se ajuste con la tension de las mismas cuerdas.
Suerte.