En principio te diría que si, si estás los 2 minutos tocando de forma agresiva y sin descasar un solo segundo. Sería como sujetar una mancuerna de poco peso durante varios minutos.
Ahora, si tocad lento fijándote donde va cada dedo, digamos a 80bpm a corcheas y te duele la mano, estás tocando con demasiada tensión. Lo que debes de hacer es aprender a relajar la mano. Piensa que para pulsar las cuerdas hace falta muy poca presión y que cuando no se sabe algo automáticamente la mano se pone rígida (al menos cuando uno está emepzando).
En este video te dejo un ejercicio para que relajes la mano al tocar y otro de sweep picking:
