Deberías distinguir entre dolor por fatiga (normal)o dolor por inflamación.
El dolor por fatiga ocurre cuando la musculatura de tu mano y dedos no está lo suficientemente entrenada para el ejercicio que conlleva el tocar la guitarra y en especial cejillas y posiciones de la mano más complicadas. Es lo mismo que cuando sales a correr sin haber entrenado... al cabo del rato te duele todo, no te pasa nada raro, simplemente te falta entrenamiento.
Mi consejo es que calientes y estires bien antes de tocar, moviendo la muñeca con gestos circulares, después unas cuantas escalas a velocidad moderada para ir avisando a tus músculos de que viene lo bueno
. Esto no va a hacer desaparecer el dolor por fatiga inmediatamente, solo la práctica continuada, el ir cada día un poco más allá le dará el "fondo" a tus manos como para que el dolor (molestias mejor) vayan desapareciendo. Hay que sufrir un pelín para estar bien entrenado.
En cuanto a los bends, intenta hacerlos con más de un dedo, esto te ayudará a que no tengas que hacer tanta fuerza, pero como te digo también la fuerza se gana con la práctica.
Dicho todo esto, si el dolor fuera por inflamación (tendinitis, torceduras etc) no hay más remedio que parar hasta solucionar ese problema y después volver a seguir.
Espero te ayude.