Vamos por partes.
Cada dos trastes la tonalidad cambia, por ejemplo, la de F sería a partir del traste 1, la de G en el 3, la de A en el 5, etc.
Las posiciones que se te marcan ahí son notas que puedes usar en una composición sin que suene mal.
Aparte de saberte las 5 posiciones de memoria, debes aprender su composición, los acordes que se pueden realizar en la tonalidad elegida, etc. esto no es porque sí, todas, las canciones que escuchas llevan una escala para sonar bien, sonaría muy raro si mezclaras las notas de una escala menor con la de una mayor, que es lo que suele pasarle a los que creen que para improvisar debes tocar a lo loco (ahorita te explico eso).
Una escala mayor es una escala con notas que dan un sonido más alegre, mientras que las menores se utilizan para canciones más pesadas, tristes o hasta de temática oscura, te dejo este video para que veas de forma muy drástica lo que pasaría si usaras una mayor en una canción de tono oscuro.
Las escalas pueden servirte no solo para componer, sino también para improvisar, pero esto requiere práctica y que te sepas totalmente la escala, no es lo mismo el hacer una composición, porque fácilmente puedes agarrar una hoja con las notas y con ella hacer la composición a improvisar bien y con cada posición marcada en tu mente.
Espero que te haya servido de algo, saludos.