Compañero, el aceite de limon es para mástiles de palorrossa. Tu guitarra es arce, no le eches eso que te lo cargas.
Podrías subir una foto de ese negro en los trastes, pero si dices que tiene unos cuantos años debe ser por desgaste natural de la madera.
Los fabricantes les suelen aplicar un barniz para protegerlo, pero no es infinito.
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#1 SIn foto es dificil de saber, pero creo que lo que indicas es debido al adhesivo que usan para los inlays, en mi caso me pasa con una LT EC 500 que tengo como desde hace 6 años, al principio no se veia y ahorita despues de mucho tiempo se nota, incluso en lugares donde nunca toco como los trastes 23-24 y en la altura que tampoco toco que es la 4ta, 5ta y 6ta cuerda, estos trastes en estas altura nunca los toco y tienen las manchas que están presentes en todos los inlays a lo largo del diapasón, al parecer son normales con el tiempo, como el amarillentado en ciertos colores o el crackeado en la nitrocelulosa, saludos