yo no creo que sea un problema de resistencia física, lo que debe pasar es que tocas tenso y por eso te cansas. Intenta tocar relajado, concéntrate primero en eso antes que en correr, que no haya tensión en ninguna mano. Haz esta prueba si te parece:
1- empieza por tocar lo mismo que estés tocando ahora, pero más lento, a una velocidad que puedas relajar los músculos
2- sube la velocidad poco a poco
3- en cuanto notes que hay tensión en algun punto de tus manos (cualquiera de las dos), corrígelo
4- una vez lo hayas corregido, puedes aumentar la velocidad un poco más
Te será muy difícil tocar muy rápido si tocas con tensión, en cambio de esta forma progresarás más rápido en general. Otra cosa que has de tener en cuenta es que la púa, una vez ha tocado la cuerda, no se debe separar demasiado, es decir, has de hacer el movimiento justo pero no más. Cuanto menos espacio hagas recorrer la púa, menos tiempo necesitas, más rápido podrás ir.
No lo notarás inmediatamente, pero verás como a medio plazo estas cosas te ayudan.
Un saludo!