Hola, amigo.
Son preguntas un poco largas de explicar.
1. La diferencia entre mayor y menor, tanto en acordes como en escalas, es que la TERCERA es mayor o menor. Ahí estamos hablando de intervalos, y ya que te estás aprendiendo las notas en el diapasón apréndete también los intervalos en él, en el diapasón.
El Rincón del Guitarrista - Acordes Arpegios Escalas
En este otro link hablamos de aprenderse las notas en el diapasón y de cómo hacerlo.
¿es absolutamente necesario saberte escalas, acordes y modos para tocar bien la guitarra? - Página 2 - Guitarristas.info
2. Esto son los modos. Por orden son, jónico, dórico, frigio, lidio, mixolidio, eólico y locrio.
Como le das fuerte a la teoría te paso este curso bastante completo.
http://imhaserri.files.wordpress.com/2007/08/curso_de_teoria.pdf
3. Hay escalas para cada nota, sí. Tanto pentatónicas, como diatónicas (escala mayor y menor), menor melódica, menor armónica, disminuída, etc...y cualquier escala que te vayas a encontrar por muy exótica que sea.
4. Ten en cuenta que una escala no es un solo. Ve combinando notas de la escala, saltos de cuerdas, toca en vertical, horizontal y diagonal, y emplea las técnicas de expresión musical: bends, vibratos, armónicos, alargar notas, silencios, hammer ons, pull offs, tapping, slides, algún cromatismo, y toca de oído. Si no haces todo esto vas a sonar a escala para arriba y escala para abajo, o sea, como si estuvieras practicando la escala todo el rato. Recuerda que una escala no es un solo.