si bajas las cuerdas no deberia trastear a no ser que los trastes esten desnivelados, no necesitas regular el alma porque hay siempre la misma tensino en las cuerdas..pero ten en cuenta que el alma tiene que estar casi derecho que al pulsar primero y 12 traste , por debajo del 7 mo pase una tarfeja de cretivo y un poco menos....
Por lo de bajar las pastillas, si las bajas tendras mas sustain ya que las cuerdas al estar mas cerca a los magnetos del pickup vibraran menos porque tienen mas atraccion....al estar mas lejos perderas volumen, son los pros y los contras.
saludos