Tienes una aplicación que se llama wine para arrancar programas de windows en linux, pero deberas intentar encontrar una buena manera de instalarlo y de usarlo, pero yo creo que si es posible.
Lo que pasa es que es una consola de windows que trabaja en ubuntu.
Mira una de las instalaciones de ubuntu es instalar windows y ubuntu a la vez con el que tendras un menu de arranque para elegir que sistemas operativo quieres tener.
Esta instalación se hace particionando tu disco duro.
En una de ellas tendras el windows si puedes hacer la particion sin formatear pues mucho mejor.En NTFS
En la otra tendras ubuntu.en EXT4.
Y crearas una particion pequeñita con el tamaño del doble de tu memoria ram osea si tienes 2g pues le haras una particion de 4G.Que servira de punto de intercambio.En SWAP
Primero partiendo siempre de tener windows instalado es lo primero que tienes que hacer para que te coja bien el menu de arranque.
La nueva versión de ubuntu es para todo el mundo tanto usuarios que quieren tener aplicaciones windows como los que quieren tener aplicaciones solamente en ubuntu.
Un abrazo espero haberte ayudado.