A mi siempre me ha dado la sensación de que los armónicos naturales tienen mucho más sustain que los artificiales. No obstante también se pueden hacer con el artificial, como habitualmente hace Satriani en esa imágen típica suya, donde realiza el armónico con la mano derecha y coge la barra del trémolo con la mano izquierda.
Yo lo suelo hacer con naturales, pero porque me resulta mucho más cómodo y aguantan. Pero vaya, lo dicho, se pueden hacer con ambos.