A la hora de tocar un tema, lo ideal es utilizar el tempo que te venga en la partitura y ahí utilizar las diferentes figuras rítmicas (a veces serán negras, otras corcheas, etc), será muy raro que te encuentres temas donde todas las notas lleven la misma subdivisión rítmica (todo a negras o a corcheas, por ejemplo).
Así que entiendo que hablas de practicar escalas/arpegios/etc, en esos casos lo mejor es ir practicando con diferentes subdivisiones e incluso ir mezclándolas entre sí. Por ejemplo, puedes empezar tocando todo a negras (una nota por cada pulso del metrónomo), luego a corcheas (dos notas por pulso), luego a semicorcheas (4 notas por pulso), tresillos (3 por pulso), etc, pero siempre dentro de un tempo en el que te encuentres cómodo (tocar a tempo muchas veces es más difícil a un tempo lento que a un tempo rápido).
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